根据中共安徽省委机构编制委员会办公室《关于市级人民检察院和基层人民检察院内设机构改革方案的批复》(皖编办〈2019〉126号),淮南市大通区人民检察院设下列机构：
1、第一检察部：负责刑事犯罪案件办理
2、第二检察部：负责民事检察、行政检察、公益诉讼等检察工作
3、第三检察部：负责控告申诉、案件管理、法律政策研究、检察技术信息化及网络安全等检察工作；加挂法警大队和国家赔偿工作办公室牌子
4、办公室
5、政治部
6、派出机构：上窑检察室
纪检监察机构和党的基层组织按有关规定设置。
